Já tam těch problémů vidím víc: předně, URL musí začínat www, tedy do .htaccess si přidejte řádky
Kód:
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^neco.cz [NC]
RewriteRule ^(.*)$ http://www.neco.cz/$1 [R=301,QSA,L]
Dále, URL souboru musí končit příponou .html, to si zapněte v JoomSEF. Pak, ten VirtueMart je zřejmě 1.1.7, to je tedy velmi staré a divím se, že to není aktualizované alespoň na 1.1.9. Noa po tom všem vymažte v administraci JoomSEF jeho adresy, překontrolujte si, že nemáte v něm zapnuté ukládání do cache a tu pro jistotu také vymažte. Poté si projděte e-shop (náhodně klikněte na různé zboží), aby se ty adresy vytvořily znovu a musí to fungovat.
Pokud ne, tak vypněte JoomSEF, jestli to poté bude fungovat.